Esta formação prática, organizada por investigadores do UCIBIO em colaboração com o LIP, destina-se a investigadores interessados em iniciar ou aprofundar projetos de Computação de Alto Desempenho (HPC) aplicados às Ciências da Vida. O programa inclui uma introdução opcional aos conceitos e à utilização de clusters HPC, seguida de módulos especializados em análise de dados de sequenciação de alto débito, montagem de transcriptomas, filogenómica, rastreio virtual baseado em estrutura, dinâmica molecular e métodos híbridos de mecânica quântica/mecânica molecular. A formação combina conceitos teóricos com exercícios práticos, proporcionando competências para a utilização eficiente de infraestruturas HPC em investigação biomédica e bioinformática.
Módulos:
OPTIONAL Module 0:
Introduction to HPC (Feb 5, 10:00 – 12:00)
(required module for the users who don’t have any knoledge about HPC)
Online hand-on tutorial on which users will learn how to use the INCD HPC cluster.
Module 1 (OMICS):
High-throughput Sequencing Data (Feb 6, 09:00 – 12:30)
Transcriptome Assembly (Feb 6, 14:00 – 17:30)
Phylogenomics (Feb 7, 09:00 – 12:30)
Module 2 (Molecular Modeling)
Structure-based Virtual Screening (Feb 7, 14:00 – 17:30)
Molecular Dynamics (Feb 8, 09:00 – 12:30)
Hybrid Quantum Mechanics/Molecular Mechanics (Feb 8, 14:00 – 17:30)